El Colegio Gonzaga está dirigido por un Consejo Directivo conformado por:

•  P. Daniel Figuera S.J.
  
  Rector / Director
  
  
  
• Lcda. Eneida Tapia
  
  Sub-Directora de Educación Media General
  
  
  
  
  
•  Lcda. Egle Vílchez
  
  Sub-Directora de Educación Primaria